Uživatelské prostředí GeoGebra Grafického kalkulátoru zahnuje Algebrické okno, Panel nástrojů, Tabulku a Grafické okno. Všechny části jsou dynamicky propojeny, to znamená, že každá změna provedená v jedné z nich je automaticky zobrazena i v dalších. Příklady:

• Změňte předpis funkce v  Algebraickém okně a pozorujte, jak se přizpůsobí/změní graf funkce v Grafickém okně.
• Změňte tahem polohu bodu v Grafickém okně a pozorujte, jak se změnily souřadnice bodu v  Algebraickém okně.

Panel nástrojů otevřete kliknutím na jeho ikonu. Po kliknutí na ikonu se otevře nabídka kategorií obsahující různé nástroje. Zvolte nástroj, který potřebujete a sestrojte objekt v Grafickém okně. Poznámka: Panel nástrojů obsahuje výběr nejdůležitějších nástrojů na základní konstrukce. Kliknutím na VÍCE ve spodní části Panelu nástrojů se zobrazí další nástroje.

Kliknutím na ikonu  Algebraické okno se otevře Algebraické okno. Do Vstupního řádku je možné pomocí klávesnice zadat předpis, příkaz nebo funkci. Tyto objekty budou po zadání předpisu zobrazeny v Grafickém okně. Stejně tak se numerický předpis objektů sestrojených v Grafickém okně zobrazí v Algebraickém okně.

Tabulku otevřete kliknutím na ikonu Tabulka. Pokud jste aktivovali tabulku hodnot funkce, naleznete ji právě zde.

Pokud dáváte přednost práci pouze v Grafickém okně Algebraické okno, Panel nástrojů a Tabulku můžete skrýt kliknutím na . Zobrazit je znovu můžete kliknutím na .

 Menu Grafického kalkulátoru naleznete v levém horním rohu. Můžete zde vytvořit nový soubor, otevřít již existující, uložit a sdílet Vaši konstrukci, změnit nastavení, otevřít další GeoGebra aplikace nebo si přečíst nápovědu.

Kliknutím na ikonu Zpět se ve Vaší konstrukci vrátíte o krok zpět. Kliknutím na ikonu Zpět se zobrazí i ikona Znovu, která zpětný krok znovu vrátí. Poznámka: Zpět se zobrazí automaticky po sestrojení prvního objektu.

Kliknutím na ikonu Nastavení v pravém horním rohu se otevře Nastavení. Zde můžete z nabídky vybrat možnost zobrazit osy/mřížku, přichytit k mřížce, odstranit všechny stopy a zobrazit všechny objekty. Další z možností je Pokročilé nastavení, ve kterém naleznete Obecné nastavení (jazyk, velikost písma, zaokrouhlování..), Nastavení Grafického okna (mřížka, osy X a Y - jejich vzdálenost, rozměry..) a Nastavení Algebraického okna (popisy).